Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2J2Q9GZM3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2J2Q9GZM3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms