Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSX2Q9BZM3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GSX2Q9BZM3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms