Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms