Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf16Q9BUW7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf16Q9BUW7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms