Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBGCP2Q9BSJ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBGCP2Q9BSJ2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms