Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms