Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNS3Q9BQ31 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNS3Q9BQ31 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms