Protein–RNA interactions for Protein: Q99705

MCHR1, Melanin-concentrating hormone receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCHR1Q99705 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCHR1Q99705 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCHR1Q99705 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCHR1Q99705 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms