Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LYSTQ99698 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms