Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAP1L3Q99457 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L3Q99457 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NAP1L3Q99457 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms