Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC38A2Q96QD8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A2Q96QD8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms