Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00479Q96M42 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00479Q96M42 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms