Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MARK4Q96L34 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK4Q96L34 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms