Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAGED4Q96JG8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAGED4Q96JG8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 856.1 ms