Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN17Q96FV3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN17Q96FV3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms