Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC58Q96CX6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC58Q96CX6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms