Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC8Q96B26 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms