Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRN2Q92932 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRN2Q92932 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRN2Q92932 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
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