Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UFD1Q92890 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms