Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAD50Q92878 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RAD50Q92878 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms