Protein–RNA interactions for Protein: Q92832

NELL1, Protein kinase C-binding protein NELL1, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL1Q92832 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELL1Q92832 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NELL1Q92832 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NELL1Q92832 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELL1Q92832 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELL1Q92832 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NELL1Q92832 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NELL1Q92832 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELL1Q92832 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELL1Q92832 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms