Protein–RNA interactions for Protein: Q92523

CPT1B, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPT1BQ92523 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPT1BQ92523 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPT1BQ92523 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPT1BQ92523 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPT1BQ92523 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPT1BQ92523 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPT1BQ92523 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPT1BQ92523 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPT1BQ92523 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPT1BQ92523 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPT1BQ92523 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPT1BQ92523 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPT1BQ92523 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPT1BQ92523 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CPT1BQ92523 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPT1BQ92523 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPT1BQ92523 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPT1BQ92523 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPT1BQ92523 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPT1BQ92523 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms