Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATAD2BQ8WXI9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATAD2BQ8WXI9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms