Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PYDC1Q8WXC3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PYDC1Q8WXC3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms