Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGARPQ8TDB4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms