Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV9

RHOXF1, Rhox homeobox family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1Q8NHV9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF1Q8NHV9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF1Q8NHV9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms