Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP43Q8NFH3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms