Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD9Q8NE22 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms