Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC197Q8NCU1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC197Q8NCU1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms