Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FSIP1Q8NA03 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FSIP1Q8NA03 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FSIP1Q8NA03 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms