Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2U9

PQLC1, PQ-loop repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1Q8N2U9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PQLC1Q8N2U9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PQLC1Q8N2U9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms