Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN4BQ8IWT1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN4BQ8IWT1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms