Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYT9Q86SS6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT9Q86SS6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms