Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7H5

TMED4, Transmembrane emp24 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED4Q7Z7H5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMED4Q7Z7H5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED4Q7Z7H5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms