Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM46Q7Z4K8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM46Q7Z4K8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms