Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPUQ71F23 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPUQ71F23 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPUQ71F23 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPUQ71F23 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPUQ71F23 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPUQ71F23 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPUQ71F23 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPUQ71F23 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPUQ71F23 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPUQ71F23 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPUQ71F23 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPUQ71F23 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPUQ71F23 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPUQ71F23 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPUQ71F23 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPUQ71F23 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPUQ71F23 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPUQ71F23 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms