Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACS1Q6VY07 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACS1Q6VY07 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms