Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRIG3Q6UXM1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms