Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL17Q6TDP4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL17Q6TDP4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL17Q6TDP4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms