Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZBED9Q6R2W3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZBED9Q6R2W3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.14■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZBED9Q6R2W3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms