Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BLOC1S2Q6QNY1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
BLOC1S2Q6QNY1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms