Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CASC4Q6P4E1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASC4Q6P4E1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms