Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEPROQ6NW34 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms