Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUS6

TCTN3, Tectonic-3, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN3Q6NUS6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCTN3Q6NUS6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCTN3Q6NUS6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCTN3Q6NUS6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCTN3Q6NUS6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCTN3Q6NUS6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCTN3Q6NUS6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCTN3Q6NUS6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCTN3Q6NUS6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCTN3Q6NUS6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCTN3Q6NUS6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCTN3Q6NUS6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCTN3Q6NUS6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN3Q6NUS6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN3Q6NUS6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms