Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX4IPQ5VYV7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX4IPQ5VYV7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms