Protein–RNA interactions for Protein: Q5T481

RBM20, RNA-binding protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM20Q5T481 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM20Q5T481 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM20Q5T481 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms