Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HP1BP3Q5SSJ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HP1BP3Q5SSJ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms