Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL39P5Q59GN2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL39P5Q59GN2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms