Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HS1BP3Q53T59 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HS1BP3Q53T59 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HS1BP3Q53T59 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HS1BP3Q53T59 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HS1BP3Q53T59 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HS1BP3Q53T59 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HS1BP3Q53T59 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HS1BP3Q53T59 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms