Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPAT3Q53EU6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms